Higan no Hibana-san mengikuti kisah seorang gadis muda yang berjuang untuk menemukan jati dirinya di tengah pergolakan emosional dan tantangan kehidupan sehari-hari. Ia mengalami berbagai konflik internal dan eksternal yang menguji keteguhan hati serta kemampuannya untuk bangkit dari kesulitan. Dalam perjalanan hidupnya, dia bertemu dengan berbagai karakter yang memberikan pengaruh signifikan terhadap pandangan dan sikapnya. Cerita ini mengangkat tema tentang pertumbuhan pribadi, persahabatan, dan harapan di tengah keindahan dan kesedihan musim gugur.